豆蔻属药用植物DNA条形码鉴定研究

作者： 石林春 ; 宋经元 ; 陈士林 ; 姚辉 ; 韩建萍

摘要：目的：针对鉴定十分困难的豆蔻属药用植物筛选适合其鉴定的DNA条形码序列，探索豆蔻属药用植物鉴定新方法。方法：对该属植物36个物种，46个样本的8个候选条形码序列（psbA—trnH,macK,rbcL，psbK-psbI,rpoB，atpB—rbcL，ITS，I稻2）进行PCR扩增、测序和序列分析，我们采用了4种方法对于数据进行分析，应用Mega4．1计算不同序列的种间和种内遗传距离（K-2P）；用Wilcoxon秩和检验比较不同序列的变异性；用Taxon DNA软件评估“Barcoding Gap”；用Blast、Distance方法检验物种鉴定的可靠性。结果：ITS2和ITS序列变异显著，物种水平鉴定成功率达100％，其它6个候选序列（psbA—trnH，marK，rbcL，psbK-psbI,rpoB，atpB—rbcL）不能有效鉴定豆蔻属物种。结论：本文推荐将ITS2和ITS作为豆蔻属药用植物潜在的DNA条形码序列，并依此建立该属药用植物的DNA条形码鉴定方法。

关键字： 豆蔻属 DNA条形码 鉴定

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