刺五加Actin基因cDNA全长序列的克隆与生物信息学分析

作者： 柴丽花 ; 修乐山 ; 周秘 ; 邢朝斌

摘要：目的：克隆刺五加Aetin基因的全长cDNA序列，并对其进行生物信息学分析。方法i以刺五加的叶片为材料，提取总RNA，逆转录为cDNA，根据初步克隆到的刺五加Actin基因保守序列设计引物，利用套式PCR进行3’和5＇RACE扩增，得到Aetin基因的3’和5’端cDNA序列片段，拼接获得cDNA全长。将该序列进行BLAST比对、相似度分析，并对刺五加Aetinl蛋白的二级结构和三级结构进行预测。结果：刺五加的Aetin基因全长1507bp，命名为ESActinl，注册号KC469585。该基因开放阅读框（ORF）长1134bp，编码377个氨基酸，5’端非编码区长140bp，3’端非编码区长233bp。ESAetin1与GenBank中注册的其它植物肌动蛋白核苷酸序列的相似性在75％以上，蛋白质序列的相似性在94％以上。结论：首次报道了刺五加Actin基因的全长cDNA序列，为刺五加的分子生物学研究奠定基础。

关键字： 刺五加 肌动蛋白 克隆 生物信息学分析

上一篇：大孔吸附柱色谱法优选接骨木的纯化工艺
下一篇：基于ITS2序列的车前子原植物及其混伪品的分子鉴定