种子植物matK引物通用性分析研究

作者： 石林春 [1] ; 刘金欣 [2] ; 姚辉 [1] ; 徐晓兰 [1] ; 辛天怡 [1] ; 谢彩香 [1] ; 宋经元 [1]

摘要：matK是植物DNA条形码鉴定的核心序列之一,其引物通用性一直存在争议。然而,matK不同引物通用性的差异及其在不同植物类群中通用性的差异尚缺乏系统研究。本研究收集种子植物36个目,239个科,3 292个属11 429个种的14 563条全长matK序列。利用生物信息学方法,分析13对matK引物及其78种两两引物组合的通用性。结果表明引物xf/5r、1F/8R、390F/1326R和3F_KIM/1R_KIM是通用性最高的4对引物,在所有种子植物中分别为91.18%、84.65%、79.81%和80.94%;不同种子植物类群（目）,通用性最高的引物存在差异;xf/5r是引物组合的基础序列,1F/8R、1F/1R、M3/M4和3F_KIM/1R_KIM可作为引物组合的补充引物。本研究为种子植物不同类群（目）DNA条形码鉴定matK序列引物的选择提供有价值的参考。

关键字： DNA条形码 种子植物 matK 引物通用性

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