期刊信息
刊名： 世界科学技术-中医药现代化
主办： 中科院科技政策与管理科学研究所;中国高技术产业发展促进会
周期： 月刊
出版地：北京市
语种： 中文
开本： 大16开
ISSN： 1674-3849
CN： 11-5699/R
邮发代号： 2-534
复合影响因子： 0.786
综合影响因子： 0.473
历史沿革：
现用刊名：世界科学技术-中医药现代化
曾用刊名：世界科学技术-中药现代化;世界科学技术
创刊时间：1999
核心期刊：
中文核心期刊(2017)
主办： 中科院科技政策与管理科学研究所;中国高技术产业发展促进会
周期： 月刊
出版地：北京市
语种： 中文
开本： 大16开
ISSN： 1674-3849
CN： 11-5699/R
邮发代号： 2-534
复合影响因子： 0.786
综合影响因子： 0.473
历史沿革：
现用刊名：世界科学技术-中医药现代化
曾用刊名：世界科学技术-中药现代化;世界科学技术
创刊时间：1999
核心期刊：
中文核心期刊(2017)
基于本草基因组学应用流式量测序技术检测人参基因组大小
作者： 张小燕 [1] 刘志香 [2] 廖保生 [2] 肖水明 [2] 徐江 [2] 盛玮 [3]
摘要：人参(Ginseng)是五加科植物人参(Panax ginsengC.A.Mey.)的干燥根和根茎.由于其基因组数据的缺乏制约了人参基础研究和产业发展.本实验以水稻(Oryza sativa ssp.Nipponbare)和大豆(Glycine max (L.) Merrill)为内参,通过流式细胞术检测人参基因组大小约为3.42 Gb;同时,分别构建人参基因组插入片段大小为250 bp和500 bp的鸟枪法(shotgun)文库,利用Illumina HiseqXTen平台进行双端PE 150高通量测序,过滤原始测序数据后获得183.82 Gb高质量数据,K-mer分析法预估人参基因组大小为3.35 Gb,测序深度为54.87 X.本研究采用流式细胞术结合K-mer分析法测定人参基因组大小,为人参全基因组测序以及本草基因组学的研究提供基础数据.
关键字： 人参 基因组大小 流式细胞术 高通量测序 本草基因组学