峨眉山区桑科药用植物ITS2条形码序列鉴定

作者： 任瑶瑶 张良 谢博文 江南屏 刘睿颖 谭睿

摘要：目的:评价以ITS2序列作为DNA条形码对峨眉山区桑科药用植物的鉴定作用.方法:于四川峨眉山地区采集桑科药用植物样本25个,提取DNA,对其ITS2序列进行PCR扩增并测序,从GenBank上下载23条同科ITS2序列;运用MEGA6.0对所有序列种间种内遗传距离进行计算分析,构建Neighbor Joining (NJ)系统进化树;利用TAXON DNA软件分析所有序列种内、种间变异并作barcoding gap分析;从ITS2数据库中预测并比较样本ITS2序列的二级结构差异.结果:桑科样本种间K2P最小遗传距离(0.041)大于种内最大距离(0.005),并有较为明显的barcoding gap;NJ树显示种各属样本分别聚为一大枝,种内之间于各属分支中各聚为一支;各属及各种样品ITS2二级结构存在明显差异.结论:以ITS2序列作为DNA条形码,能够对桑植物进行准确、快速的识别和鉴定,准确地弄清物种之间的系统进化关系,为峨眉山区该属药用植物的分布、种群及种群量研究提供指导,对其质量控制、安全用药及资源保护及合理开发利用提供理论依据.

关键字： 桑科 DNA条形码 ITS2序列 二级结构 鉴定 资源调查

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