几种天然产物与CASP3靶点的相互作用机制探索

作者： 张静晓 刘晓洁 杨春 陈盼盼 张丽雷

摘要：目的:研究几种中药有效成分与CASP3靶点的相互作用,分析其作用机理及结构特征,为CASP3抑制剂的开发提供参考.方法:基于前期研究,本文选择几种天然产物的有效成分,采用分子对接和分子动力学方法模拟其与CASP3靶点之间的相互作用,通过作用力分析配体和靶点的作用机制.结果:筛选出的丹参酮ⅡA和野黄芩苷与CASP3靶点的结合能力较强,通过分子动力学方法分别获取了丹参酮ⅡA和野黄芩苷与CASP3结合的理论稳定结构.丹参酮ⅡA与CASP3中的Phe256、Ser205、Trp206等4个氨基酸残基具有疏水作用,形成1个氢键.野黄芩苷与CASP3靶点中的Ser249、Trp214、Trp206等9个氨基酸残基具有疏水作用,形成了7个稳定性不同的氢键,其中静电相互作用是其结合更为稳定的主要原因.结论:丹参酮ⅡA和野黄芩苷能与CASP3靶点形成较为稳定的结合结构,探索相似的结构有利于设计更有效的CASP3抑制剂.

关键字： 天然产物 CASP3靶点 细胞凋亡 分子对接 分子动力学

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